Détection moléculaire par PCR quantitative

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Accrédité par le Conseil canadien des normes au laboratoire numéro 594 - CAN-P-4E (ISO/IEC 17025)

Formulaires de demande

Détails de la référence

Description:

Détection du virus BK par PCR quantitative.

Catégorie d'analyse:
Détection moléculaire
Agent pathogène:
Virus BK (BKV)
Infections et maladies:
  • Cystite hémorragique
  • Néphropathie chez des patients ayant subi une greffe de rein
Spécimen:

Plasma, urine, pièces de biopsie fraîches, ou tissus fixés.  Ne pas envoyer de sang total. Volume requis : plasma : 1 mL (minimum de 0.5 mL); urine : 2 mL  (minimum de 1 mL). Le sérum ne sera pas accepté. L’essai n’a pas été validé pour ce type d’échantillon et la quantification précise ne peut être assurée.  Le volume minimal ne permet pas une répétition des analyses d’échantillons ayant un résultat équivoque.

Méthode de prélèvement:

Pour le plasma, prélever le sang dans un tube séparateur de plasma (PPT) ou un tube contenant de K2EDTA (plastique; à bouchon lavande ou rose). Ne pas utiliser d'héparine comme anticoagulant. Centrifuger le tube à la température ambiante à une FCR de 1 100 pendant 10 15 minutes. Décanter le plasma dans un tube distinct.

Manipulation, entreposage et expédition des spécimens:

Le plasma et l'urine peuvent être conservés et expédiés réfrigérés au LNM dans les 48 h suivant le prélèvement, sinon, ils doivent être conservés et expédiés congelés. Les pièces de biopsie fraîches doivent être conservées au congélateur en tout temps et expédiées sur de la glace sèche. Les tissus fixés peuvent être conservés et expédiés à la température ambiante.

Transport des marchandises dangereuses:

L'expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d'information sur la catégorisation des matières à des fins d'expédition, veuillez consulter la partie 2 de l'appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l'IATA sur les produits dangereux.

Pour obtenir des renseignements supplémentaires dans d’autres langues sur le transport de matières infectieuses, cliquez sur le lien ci-dessous.

http://www.who.int/ihr/capacity-strengthening/infectious-substances/fr/

 

Critères relatifs aux patients:

Test de confirmation et de référence pour les résultats équivoques ou les diagnostics complexes. Les échantillons destinés à une surveillance systématique des patients ayant subi une greffe ne seront pas acceptés, à moins qu'ils fassent partie d'une étude pré établie menée en collaboration.

Documents d'accompagnement:

La requête d'analyse pour « ITS virales, polyome et herpèsvirus » comprend, pour l'expéditeur, le nom, l'adresse et le numéro de téléphone et, pour le patient, le nom-code, la date de naissance, le sexe, le no de référence de l'échantillon, le type d'échantillon, la date de prélèvement, le test requis et toute autre information clinique pertinente.

Commentaires:

S/O

Méthodes et interprétation des résultats:

PCR quantitative multiplex basée sur la technologie TaqMan (1), détectant à la fois les virus JC et BK. Sensibilité analytique entre 10 et 100 copies du génome BK. La limite de quantification est de 100 copies par réaction. Les résultats sont rapportés en nombre de copies par mL du spécimen. Un nombre élevé de copies indique une plus forte probabilité de réactivation de l’infection (dans l’urine) et une infection plus grave. Aucune quantification possible sur les tissus biopsiés. Veuillez noter qu’en ce qui concerne l’analyse des échantillons fixés à la formaline, il se peut que le BKV ne soit pas détecté en raison d’une sensibilité plus faible de l’épreuve.

Délai d'exécution:

14 jours civils. Des échantillons STAT peuvent être envoyés dans certaines circonstances. Veuillez communiquer avec le laboratoire pour vous renseigner sur les délais d'exécution plus courts.

Coordonnées:
Téléphone: (204) 789-6024
Télécopieur: (204) 318-2222
Références:
  1. Dumonceaux T.J., Mesa C., and Severini A. 2008. An internally controlled, triplex quantitative PCR assay for human polyomaviruses JC and BK. J. Clin Microbiol. 46:2829-2836.
Fiches d'information:
Lignes directrices:
Renseignements connexes: