Détection moléculaire du virus de l'encéphalite équine de l'Est par RT-PCR

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Détails de la référence

Description:

Détection moléculaire du virus de l'encéphalite équine de l'Est par RT-PCR.

Catégorie d'analyse:
Détection moléculaire
Agent pathogène:
Virus de l'encéphalite équine de l'Est (EEEV)
Laboratoire:
Infections et maladies:
  • Encéphalite équine de l'Est
Spécimen:

Les échantillons de sérum sont préférables; toutefois, les tests peuvent aussi être réalisés sur des échantillons de plasma ou de liquide céphalo-rachidien (LCR). L’analyse d’autres liquides et tissus corporels pourrait être envisagée; veuillez communiquer avec le laboratoire de diagnostic des zoonoses virales pour vérifier si d’autres échantillons peuvent être utilisés. Le volume minimum est de 600 µl.

Méthode de prélèvement:

Prélever le sang dans des tubes de séparation du sérum – soumettre dans un tube en « O » de 2 ml.

Manipulation, entreposage et expédition des spécimens:

Congeler les échantillons jusqu’au moment de leur envoi pour analyse. Expédier les échantillons congelés sur glace sèche.

Transport des marchandises dangereuses:

L'expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d'information sur la catégorisation des matières à des fins d'expédition, veuillez consulter la partie 2 de l'appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l'IATA sur les produits dangereux.

Pour obtenir des renseignements supplémentaires dans d’autres langues sur le transport de matières infectieuses, cliquez sur le lien ci-dessous.

http://www.who.int/ihr/capacity-strengthening/infectious-substances/fr/

 

Critères relatifs aux patients:

Infection par le virus de l’encéphalite équine de l’Est soupçonnée.

Documents d'accompagnement:

Requête d’analyse pour les zoonoses virales complétée, incluant le nom, l’adresse et le numéro de téléphone du laboratoire expéditeur. Le nom ou l’identificateur (no de référence de l’échantillon) du patient, sa date de naissance, les analyse(s) demandée(s), le type d’échantillon, la date de prélèvement de l’échantillon, la date du début des symptômes, ainsi que l’histoire clinique et les antécédents de voyage du patient.

Commentaires:

Il est à noter qu’il est crucial d’indiquer la date de prélèvement de l’échantillon et la date d’apparition des symptômes pour aider à déterminer les analyses à effectuer et pour l’interprétation des résultats.

Méthodes et interprétation des résultats:

Détection du virus EEE par RT-PCR en temps réel TaqMan. Deux épreuves uniplex distinctes ciblant deux régions génomiques distinctes sont réalisées; un résultat est jugé positif si les deux cibles sont détectées et si chaque valeur Ct se situe à l’intérieur du seuil préétabli pour chaque épreuve. Si une seule des cibles est détectée, le test est répété et/ou d’autres plateformes d’analyse peuvent être utilisées pour permettre l’interprétation du résultat.

Délai d'exécution:

21 jours civils après la date de réception de l’échantillon.

Coordonnées:
Téléphone: (204) 789-6097 or (204) 789-2106
Télécopieur: (204) 789-2082
Références:
  1. Armstrong, P.M., Prince, N., & Andreadis, T.G. (2012). Development of a multi-target TaqMan assay to detect Eastern Equine Encephalitis virus variants in mosquitoes. Vector-Borne and Zoonotic Diseases, 12(N10), 872-876.
  2. Hull, R., Nattanmai, S., Kramer, L.D., Bernard, K.A., Tavakoli, N.P. (2008). A duplex real-time RT-PCR assay for the detection of St. Louis encephalitis and Eastern equine encephalitis viruses. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease, 62(3), 272-279.                             
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