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Détection moléculaire par PCR

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Détails de la référence

Description:

Détection moléculaire du Ehrlichia chaffeensis dans des échantillons cliniques.

Catégorie d'analyse:
Détection moléculaire
Agent pathogène:
Ehrlichia chaffeensis
Infections et maladies:
  • Ehrlichiose
Spécimen:

Sang total ou couche leucoplaquettaire sont recommandés ou de liquide céphalorachidien (LCR) prélevé chez les patients dont l’état clinique semble indiquer une méningite. Les volumes minimaux sont les suivants:

  • sang total – 5,0 mL
  • couche leucoplaquettaire – 0,5 mL
  • LCR  - 0,5 mL. 

Les échantillons de LCR sont acceptables pour les analyses, mais ils ne sont pas idéaux en raison de leur rendement typiquement faible.

Méthode de prélèvement:

Prélever le sang dans des tubes EDTA.  évitez l'héparine.  Ne pas centrifuge. Prélever aseptiquement une couche leuco-plaquettaire ou du LCR dans un contenant étanche et stérile fait de plastique résistant aux cycles gel-dégel et aux chocs, sans agent de conservation.

Manipulation, entreposage et expédition des spécimens:

Si le délai est supérieur à 5 jours, conserver à -20 °C et expédier sur de la glace sèche.

Transport des marchandises dangereuses:

L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.

 

Critères relatifs aux patients:

Symptômes cliniques pertinents accompagnés d’une exposition connue à la tique Amblyomma americanum (Lone Star) au Canada OU voyage dans les régions de l’Est, du Sud-Est ou du Centre-Sud des Etats-Unis. Les symptômes de l’infection à Ehrlichia chaffeensis, qui apparaissent généralement 1 à 2 semaines après la morsure par une tique infectée, peuvent comprendre : fièvre, maux de tête, frissons, malaise, douleurs musculaires, nausées, vomissements, diarrhées, confusion, infection conjonctivale et éruption cutanée.

Documents d'accompagnement:

Requête pour l’analyse moléculaire de certains agents de zoonoses dûment complétée.  Si possible, fournir les antécédents cliniques et les résultats d’analyses effectuées par le laboratoire provincial ou local. 

Commentaires:

Les échantillons qui ne constituent pas le bon type d'échantillon, dont le volume est insuffisant, ou qui ne sont pas accompagnés des antécédents de voyage ou des renseignements pertinents sur le patient peuvent être rejetés.


CE TEST EST EFFECTUÉ UNIQUEMENT À DES FINS D'ENQUÊTE OU DE RECHERCHE
 

Méthodes et interprétation des résultats:

L’ADN extrait fait l’objet d’une analyse par PCR en temps réel visant à détecter E. chaffeensis. Les échantillons positifs à la PCR en temps réel sont ensuite soumis à une analyse par PCR classique et à un séquençage pour confirmer la présence du génome d’E. chaffeensis.

Le résultat de l'épreuve PCR pourrait être affecté lorsqu'un traitement par antibiotique est initié avant l'analyse (génome réduit de la bactérie).

Délai d'exécution:

21 jours civils.

Coordonnées:
Téléphone: (204) 789-7434 or (204) 789-6060
Télécopieur: (204) 789-2082
Références:
  1. Loftis, A., D., Massung, R. F., Levin, M., L. 2003. Quantitative real-time PCR assay for detection of Ehrlichia chaffeensis. J. Clin. Microbiol. 41(8):3870-3872.
  2. Standaert, S.M., Yu, T., Scott, M.A., et al. 2000. Primary Isolation of Ehrlichia chaffeensis from patients with febrile illnesses: Clinical and molecular characteristics. J. Inf. Dis. 181:1082-1088.
Fiches d'information:
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Renseignements connexes: