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Sous-typage génomique

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*Accrédité par le Conseil canadien des normes au laboratoire numéro 594 (ISO/IEC 17025)

Formulaires de demande

Détails de la référence

Description:

Sous-typage génomique d’Escherichia coli.

Catégorie d'analyse:
Différenciation moléculaire
Agent pathogène:
Escherichia coli
Laboratoire:
Infections et maladies:
  • Gastro-entérite
  • Septicémie
  • Bactériémie
  • Méningite néonatale
Spécimen:

Isolat obtenu à partir des urines, des selles, du sang, de l’environnement, d’un aliment, etc.

Méthode de prélèvement:

Isolat fourni sur un milieu de culture approprié pour E. coli.

Manipulation, entreposage et expédition des spécimens:

Envoyer sur un milieu de culture ensemencé ou sur un milieu de transport approprié.  Le récipient de culture doit être étanche ou adéquatement scellé.

Transport des marchandises dangereuses:

L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.

 

Critères relatifs aux patients:

Gastro-entérite, septicémie, infection ou autres.

Documents d'accompagnement:

Formulaire de requête d’analyse pour le Programme des maladies entériques dûment rempli.

Commentaires:

S/O

Méthodes et interprétation des résultats:

Analyse MLST du génome entier*

Analyse SNV du génome entier

Les données seront acheminées à la section Surveillance, détection des éclosions et intervention du LNM, qui interprétera les données conformément aux lignes directrices du Réseau PulseNet Canada. Veuillez utiliser l’information ci-dessous pour communiquer avec nous en vue d’obtenir plus de renseignements sur les lignes directrices relatives à l’interprétation des données.

Délai d'exécution:

21 jours civils pour le séquen¿age du génome entier effectué à l’interne.  5 jours civils pour l’analyse des échantillons séquencés à l'échelle provincial.  À noter : Les délais d’exécution pour les isolats de routine peuvent être prolongés durant une éclosion majeure de toxiinfections alimentaires ou en raison d’une disponibilité limitée de ressources.

Coordonnées:
Téléphone: (204) 784-4827
Télécopieur: (204) 789-5012
Références: