Génotypage par RT-PCR
<<Retourner aux résultats de la rechercheAccrédité par le Conseil canadien des normes au laboratoire numéro 594 (ISO/IEC 17025)
Formulaires de demande
Détails de la référence
Génotypage du virus de l'influenza A (sous-type H1 et H3), du virus de l'influenza B, et du virus Influenza A aviaire (sous-type H1 à H16) par RT-PCR en temps réel et/ou RT-PCR et le séquençage.
- Grippe
Échantillons respiratoires (écouvillonnage rhinopharyngé, écouvillonnage de gorge, etc.), ou isolats viraux. Volume minimum require : 1 à 2 mL.
Pour obtenir des prélèvements respiratoires, utiliser des écouvillons stériles et écouvillonner la cavité nasale, la gorge, etc. Placer les écouvillons dans 2 à 3 ml de milieu de transport viral.
Conserver les prélèvements au réfrigérateur jusqu'à leur envoi au laboratoire. Les expédier sur de la glace sèche.
L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.
Infection du virus de l'influenza présumée ou confirmée.
Remplir le formulaire [Demande Relative au Programme de l'oms pour la Lutte la Grippe (Sous-Typage Antigénique), version actuelle]. Inscrire le nom, l'adresse et le numéro de téléphone du laboratoire expéditeur, sans quoi les échantillons ne seront pas traités. Inscrire également l'identifiant (numéro du laboratoire expéditeur), la date de naissance et le sexe du patient, le type d'échantillon et la date du prélèvement. Dans la section réservée aux renseignements complémentaires, inscrire (si possible / s'il y a lieu) le nombre de repiquages effectués, les antécédents de voyage du patient, l'ampleur de l'activité grippale et la date du prélèvement par rapport à la prise d'antiviraux.
Une autorisation doit être obtenue pour le génotypage par RT-PCR et par séquençage du virus de l’influenza A (sous-type H1 et H3), du virus de l’influenza B, et du virus Influenza A aviaire. Communiquer avec la section des virus de la grippe, virus respiratoires et coronavirus avant d’expédier les échantillons. Les isolats reçus trois mois après la date de collection ne seront pas testés, à moins que des dispositions aient été prises avec le chef de section.
Les acides nucléiques extraits sont soumis à une transcription inverse suivie de réaction en chaîne de la polymérase (RT PCR) avec détection en temps réel ou confirmation visuelle (électrophorèse en gel) des produits de la PCR. Les produits de la PCR conventionnelle peuvent être séquencés et comparés avec des séquences de référence afin de déterminer le génotype.
14 jours civils.
- Real-Time RT-PCR (rRT-PCR) Protocol for Influenza. CDC. Revised, 2007.
- Fouchier R. et al. Detection of Influenza A Viruses from Different Species by PCR Amplification of Conserved Sequences in the Matrix Gene. J. Clin. Microbiol. (2000) 38: 4096-4101
Définition de cas - Infection respiratoire aiguë sévère (IRAS)
Pour les professionnels de la santé : influenza aviaire (H5N1)
Protocole d’enquête microbiologique concernant les Infections Respiratoires Aiguës Sévères (IRAS)
Pour les professionnels de la santé : grippe aviaire A(H7N9)
Grippe (influenza) : Pour les professionnels de la santé
Influenza confirmée en laboratoire (incluant les nouvelles souches)