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Détection des espèces Leptospira par PCR et séquençage

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Détails de la référence

Description:

Détection de Leptospira spp. par PCR et séquençage.

Catégorie d'analyse:
Détection moléculaire et Génotypage
Agent pathogène:
Leptospira spp.
Infections et maladies:
  • Leptospirose
Spécimen:

Sang entier, urine ou LCR. Les volumes minimaux requis sont les suivants :

  • Sang entier – 2 mL
  • Urine (fraîche) – 5 mL
  • LCR – 0,5 mL

 

Méthode de prélèvement:

Recueillir le sang entier dans des tubes EDTA. ÉVITER L’HÉPARINE. Ne pas centrifuger. Prélever aseptiquement une urine ou du LCR dans un contenant étanche et stérile fait de plastique résistant aux cycles gel-dégel et aux chocs, sans agent de conservation.

Manipulation, entreposage et expédition des spécimens:

Garder au réfrigérateur des spécimens durant une période pouvant aller jusqu’à 5 jours en attendant qu’il soit expédié avec des blocs réfrigérants pour analyse. Si le délai est supérieur à 5 jours, conserver à -20 °C et expédier sur de la glace sèche.

 

Transport des marchandises dangereuses:

L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.

 

Critères relatifs aux patients:

Les symptômes d’une infection à Leptospira spp. peuvent comprendre les suivants : fièvre, céphalées, frissons, malaise général, éruption cutanée, vomissements, diarrhée, myalgies, suffusion conjonctivale, ictère, insuffisance rénale et/ou défaillance hépatique, méningite et douleurs thoraciques. Contact avec un animal infecté (chiens, bétail, ratons laveurs, rongeurs, etc.) ou voyage récent dans une région ou l’infection à Leptospira spp. est endémique.

 

Documents d'accompagnement:

Requête pour l’analyse moléculaire de certains agents de zoonoses dûment complétée.

 

Commentaires:

Les échantillons qui ne constituent pas le bon type d’échantillon, dont le volume est insuffisant, ou qui ne sont pas accompagnés des renseignements pertinents sur le patient ou des antécédents cliniques de ce dernier peuvent être rejetés.

La mise en route d’un traitement antibiotique avant l’analyse peut entraîner une production réduite d’anticorps qui altérera le résultat de l’analyse sérologique.

CE TEST EST EFFECTUÉ UNIQUEMENT À DES FINS D’ENQUÊTE OU DE RECHERCHE.

Méthodes et interprétation des résultats:

L’ADN extrait fait l’objet d’une analyse par PCR en temps réel ciblant le gène lipL32 dans les espèces pathogènes de Leptospira. Les échantillons positifs au test de détection sont ensuite soumis à une analyse par PCR confirmatoire en temps réel analyse ciblant l'ARNr de Leptospira 16S et PCR classique et à un séquençage du gène codant la citrate synthase.

Délai d'exécution:

21 jours civils.

Coordonnées:
Téléphone: (204) 789-7434 or (204) 789-6060
Télécopieur: (204) 789-2082
Références:
  1. Levett, P.N. Leptospirosis (2001) Clin. Micro. Rev. (14): 296-326.
  2. Stoddard R. A., Gee J. E., Wilkins P. P., McCaustland K., et al.2009Detection of pathogenic Leptospira spp. through TaqMan polymerase chain reaction targeting the LipL32 gene. Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 64:247255.
Lignes directrices:
Renseignements connexes: