Molecular Detection of Powassan Virus by Reverse Transcriptase PCR (RT-PCR)
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Détails de la référence
Détection moléculaire du virus de Powassan (POW)par RT-PCR.
- Encéphalite de Powassan
Les échantillons de sérum sont préférables; toutefois, les tests peuvent aussi être réalisés sur des échantillons de plasma ou de liquide céphalo-rachidien (LCR). L’analyse d’autres liquides et tissus corporels pourrait être envisagée; veuillez communiquer avec le laboratoire de diagnostic des zoonoses virales pour vérifier si d’autres échantillons peuvent être utilisés. Le volume minimum est de 600 µl.
Prélever le sang dans des tubes de séparation du sérum – soumettre dans un tube en « O » de 2 ml.
Congeler les échantillons jusqu’au moment de leur envoi pour analyse. Expédier les échantillons congelés sur glace sèche.
L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.
Infection par le virus de Powassan soupçonnée.
Requête d’analyse pour les zoonoses virales complétée, incluant le nom, l’adresse et le numéro de téléphone du laboratoire expéditeur. Le nom ou l’identificateur (no de référence de l’échantillon) du patient, sa date de naissance, les analyse(s) demandée(s), la date de prélèvement de l’échantillon, la date du début des symptômes, ainsi que l’histoire clinique et les antécédents de voyage du patient.
Il ne s’agit pas d’un test de routine.La RT-PCR sur le sérum, le plasma ou le LCR n’est pas une épreuve sensible pour le virus de Powassan. Veuillez communiquer avec le laboratoire de diagnostic des zoonoses virales avant d’envoyer des échantillons ou de demander la réalisation de cette épreuve.
Détection du virus Powassan par RT-PCR en temps réel TaqMan. Deux épreuves uniplex distinctes ciblant deux régions génomiques distinctes sont réalisées; un résultat est jugé positif si les deux cibles sont détectées et si chaque valeur Ct se situe à l’intérieur du seuil préétabli pour chaque épreuve. Si une seule des cibles est détectée, le test est répété et/ou d’autres plateformes d’analyse peuvent être utilisées pour permettre l’interprétation du résultat.
Veuillez joindre le laboratoire pour connaître les délais.
- Telford III, S.R., Armstrong, P.M., Katavolos, P, Foppa, I., Garcia, A.S.O., Wilson, M.L. and Spielman, A. A new tick-borne encephalitis-like virus infecting New England deer ticks, Ixodes dammini. Emerg Infect Dis. 997. 3: 165-170.
- Ebel, G.D., Spielman, A., and Telford III, S.R. Phylogeny of north American powassan virus. J. Gen Virol. 2001. 82: 1657-1665.