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Détermination du sérotype de Streptococcus pneumoniae

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Accrédité par le Conseil canadien des normes au laboratoire numéro 594 (ISO/IEC 17025)

Formulaires de demande

Détails de la référence

Description:

Détermination du sérotype de Streptococcus pneumonia.

Catégorie d'analyse:
Sérotypage
Agent pathogène:
Streptococcus pneumoniae
Infections et maladies:
  • Bactériémie
  • Méningite à pneumocoques
Spécimen:

Culture pure de S. pneumoniae (identification présomptive) isolée d'un site normalement stérile (à l'exclusion de l'oreille moyenne). Isolat fourni sur un milieu de culture.

Les échantillons qui ne constituent pas le bon type d’échantillon, dont le volume est insuffisant, ou qui ne sont pas accompagnés des renseignements pertinents sur le patient peuvent être rejetés.

Méthode de prélèvement:

Isolat fourni sur un milieu de culture.

Manipulation, entreposage et expédition des spécimens:

Envoyer sous forme de croissance sur milieu de culture ou sur un écouvillon dans un milieu de transport.  La gélose chocolatée et le charbon sont les milieux recommandés. Les cultures peuvent également être expédiées congelées sur glace sèche. 

 

 

Transport des marchandises dangereuses:

L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.

Critères relatifs aux patients:

Maladie invasive causée par Streptococcus pneumoniae.

Documents d'accompagnement:

 

Formulaire rempli pour l’envoi d’un isolat de streptocoque, notamment nom, adresse et numéro de téléphone du laboratoire expéditeur. Âge ou date de naissance du patient, sexe, numéro de référence de la culture, source clinique, date du prélèvement et analyse demandée. Les renseignements ci-dessus peuvent également être transmis dans un fichier Excel à l’adresse nml.strepsti-lnm.strepits@phac-aspc.gc.ca, ainsi qu’une copie papier avec l’envoi.

Commentaires:

Il est possible de soumettre des isolats non invasifs de Streptococcus pneumoniae liés à une enquête sur une éclosion. Les échantillons en double ne devraient pas être soumis sans consentement préalable. Les échantillons en double pourraient ne pas être traités. Les isolats prélevés chez un même patient à trois semaines d’intervalle sont considérés comme des échantillons en double.

 

 

 

 

Méthodes et interprétation des résultats:

Sérotypage par séquençage du génome entier (primaire) (8,9)

Sérotypage par la réaction Quellung (secondaire) (1-7)

Délai d'exécution:

30 jours civils. Les isolats urgents ou associés à une éclosion seront considérés comme prioritaires et traités le plus tôt possible. **Les délais d'exécution peuvent ne pas être garantis lorsque les isolats sont soumis en grandes quantités.

Coordonnées:
Téléphone: (204) 789-6063; STI: (204) 784-5995
Télécopieur: (204) 789-2140
Références:
  1. Austrian, R., Boettger, M. Dole, L. Fairly, and M. Fried. 1985. Streptococcus pneumoniae type 16A, a hitherto undescribed pneumococcal type. J. Clin. Microbiol. 22:127-128.
  2. Henrichsen, J. 1995. Six newly recognized types of Streptococcus pneumoniae. J. Clin. Microbiol. 33:2759-2762.
  3. Lund, E. Henrichsen J. Laboratory diagnosis, serology and epidemiology of Streptococcus pneumoniae. In: Bergan T. Norris JR, eds. Methods in Microbiology. London: Academic Press, 1978:241-262.
  4. Oftadeh,S., Satzke,C.,Gilbert,G. 2010. Identification of newly described Streptococcus pneumoniae serotype 6D using Quellung reaction and PCR. J. Clin. Microiol. 48:3378-3379.
  5. World Health Organization. 2003. Manual for the laboratory identification and antimicrobial susceptibility testing of bacterial pathogens of public health concern in the developing world.  Chapter 5.  Streptococcus pneumoniae Confirmatory Identification and Antimicrobial Susceptibility Testing. p45-62. Available at: ttp://www.who.int/csr/resources/publications/drugresist/WHO_CDS_CSR_RMD_2003_6/en/
  6. World Health Organization. 2003. Manual for the laboratory identification and antimicrobial susceptibility testing of bacterial pathogens of public health concern in the developing world.  Appendix 6.  Serotyping and Quellung Typing of Streptococcus pneumoniae. p 255-258.  Available at: http://www.who.int/csr/resources/publications/drugresist/WHO_CDS_CSR_RMD_2003_6/en/
  7. Lo SW, Gladstone RA, van Tonder AJ, et al. Global Distribution of Invasive Serotype 35D Streptococcus pneumoniae Isolates following Introduction of 13-Valent Pneumococcal Conjugate Vaccine. J Clin Microbiol. 2018;56(7):e00228-18. Published 2018 Jun 25. doi:10.1128/JCM.00228-18.
  8. Epping L, van Tonder AJ, Gladstone RA, Bentley SD, Page AJ, Keane JA. SeroBA: Rapid high-throughput serotyping of Streptococcus pneumoniae from whole genome sequence data. Microb Genom. 2018;4(7):e000186.
  9. Kapatai G, Sheppard CL, Al-Shahib A, Litt DJ, Underwood AP, Harrison TG, Fry NK. Whole genome sequencing of Streptococcus pneumoniae: development, evaluation and verification of targets for serogroup and serotype prediction using an automated pipeline. PeerJ. 2016;4:e2477.
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