Polymorphismes mononucléotidiques (SNP)

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Accrédité par le Conseil canadien des normes au laboratoire numéro 594 (ISO/IEC 17025).

Formulaires de demande

Détails de la référence

Description:

Typage moléculaire des souches de Yersinia pestis afin de déterminer les variations génétiques entre les membres d’une espèce.

Catégorie d'analyse:
Différenciation moléculaire
Agent pathogène:
Yersinia pestis
Infections et maladies:
  • Peste
Spécimen:

Culture pure.  

Méthode de prélèvement:

Culture bactérienne pure – plaque ou écouvillon.

Manipulation, entreposage et expédition des spécimens:

Entreposer les cultures bactériennes au réfrigérateur jusqu’à ce qu’elles soient expédiées aux fins de test.

Transport des marchandises dangereuses:

L'expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d'information sur la catégorisation des matières à des fins d'expédition, veuillez consulter la partie 2 de l'appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l'IATA sur les produits dangereux.

Pour obtenir des renseignements supplémentaires dans d’autres langues sur le transport de matières infectieuses, cliquez sur le lien ci-dessous.

http://www.who.int/ihr/capacity-strengthening/infectious-substances/fr/

 

Critères relatifs aux patients:

Infection confirmée à Yersinia pestis.

Documents d'accompagnement:

Requête pour l’Élaboration d’épreuves et diagnostic – microbiologie et médicolégale complétée incluant le nom, l’adresse et le numéro de téléphone de l’expéditeur.  Nom du patient ou identifiant (# du laboratoire qui le réfère), date de naissance, exposition présumée, test(s) demandé(s), histoire clinique. Type de spécimen et date de prélèvement. Si possible, inclure les antibiotiques administrés et les antécédents de voyage.

Commentaires:

S/O

Méthodes et interprétation des résultats:

La PCR permettra de définir le profil SNP; les mutations qui touchent une seule paire de bases dans un locus en particulier, habituellement composé de deux allèles, seront recherchées. 

Délai d'exécution:

14 jours civils pour un résultat final.

Coordonnées:
Téléphone: (204) 784-5928 or 1-877-212-6108
Télécopieur: (204) 789-5009
Références:
  1. Vogler AJ et al. Biotechniques. 2008 February ; 44(2): 201–207 Assays for the rapid and specific identification of North American Yersinia pestis and the common laboratory strain CO92.
  2. Andrea Ciammaruconi et al. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease 65 (2009) 7–13 A rapid allele variant discrimination method for Yersinia pestis strains based on high-resolution melting curve analysis.
  3. Giovanna Morelli et al. Nat Genet. 2010 December ; 42(12): 1140–1143. doi:10.1038/ng.705. Yersinia pestis genome sequencing identifies patterns of global phylogenetic diversity.
Renseignements connexes: