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Détection moléculaire de Bacillus anthracis

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Accrédité par le Conseil canadien des normes au laboratoire numéro 594 (ISO/IEC 17025)

Formulaires de demande

Détails de la référence

Description:

Détection moléculaire par PCR en temps réel de Bacillus anthracis.

Catégorie d'analyse:
Détection moléculaire
Agent pathogène:
Bacillus anthracis
Infections et maladies:
  • Anthrax
Spécimen:

Culture pure, sang total – volume minimum requis 0.5 mL, liquide céphalo-rachidien (LCR) – volume minimum requis 0.5 mL,  tissus de biopsie frais, poudre. 

Méthode de prélèvement:

Culture bactérienne pure – plaque ou écouvillon; Sang total – tube EDTA; Tissu ou LCR – soumettre dans un tube à prélèvement stérile; poudre – soumettre dans un microtube à centrifuger stérile de 2 ml avec joint torique.

Manipulation, entreposage et expédition des spécimens:

Entreposer les cultures bactériennes au réfrigérateur jusqu’à ce qu’elles soient expédiées aux fins de test.  Entreposer les échantillons de sang au réfrigérateur jusqu’à ce qu’ils soient expédiés aux fins d’analyse. Entreposer les échantillons de tissu et le LCR au congélateur jusqu’à ce qu’ils soient expédiés aux fins de test.

Transport des marchandises dangereuses:

L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.

 

Critères relatifs aux patients:

Infection de Bacillus anthracis soupconnée.

Documents d'accompagnement:

Requête pour l’élaboration d’épreuves et diagnostic – microbiologie médicolégale complétée incluant le nom, l’adresse et le numéro de téléphone de l’expéditeur.  Nom ou identifiant du patient (no du laboratoire demandeur), date de naissance, exposition présumée, test(s) demandé(s), antécédents cliniques, antécédents de voyage, type d’échantillon et date de prélèvement.

Commentaires:

Veuillez aviser le laboratoire avant d’envoyer l’échantillon.

Méthodes et interprétation des résultats:

La PCR en temps réel est réalisée en des épreuves internes de différenciation moléculaire visant les régions pXO1 et pXO2 de Bacillus anthracis, ainsi qu’une cible chromosomique de Bacillus anthracis.

Parmi les tests de confirmation d’un échantillon dont les résultats de PCR en temps réel sont positifs pour Bacillus anthracis, il peut y avoir lyse par bactériophage gamma, la production de capsules, l’analyse des polymorphismes mononucléotidiques (SNP), le séquençage du génome entier (WGS), et l’identification de bactéries par spectrométrie de masse à temps de vol à désorption-ionisation par impact laser assistée par matrice (SM TOF MALDI).

SM TOF MALDI sera effectuée sur tous les échantillons négatifs pour Bacillus anthracis par PCR en temps réel, pour autant que l'échantillon permette une croissance bactérienne par culture.

Délai d'exécution:

4 jours civils pour l’obtention d’un résultat préliminaire; 14 jours civils pour l’obtention d’un résultat final; 28 jours civils pour toute demande d’analyse d’échantillons non standards ou spécialisés.

Coordonnées:
Téléphone: (204) 784-5928, 1-877-212-6108 emergency
Télécopieur: (204) 789-5009
Références:
  1. Tracz, DM, et al. 2012.  Effect of gamma radiation on the identification of bacterial pathogens by MALDI-TOF MS. J. Microbiol. Methods 92, 132-134.
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