Détection moléculaire de Bacillus anthracis

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Accrédité par le Conseil canadien des normes au laboratoire numéro 594 (ISO/IEC 17025)

Formulaires de demande

Détails de la référence

Description:

Détection moléculaire par PCR en temps réel de Bacillus anthracis.

Catégorie d'analyse:
Détection moléculaire
Agent pathogène:
Bacillus anthracis
Infections et maladies:
  • Anthrax
Spécimen:

Culture pure, sang total – volume minimum requis 0.5 mL, liquide céphalo-rachidien (LCR) – volume minimum requis 0.5 mL, tissu de la biopsie, poudre.

Méthode de prélèvement:

Culture bactérienne pure – plaque ou écouvillon; Sang total – tube EDTA; Tissu ou LCR – soumettre dans un tube à prélèvement stérile; poudre – soumettre dans un microtube à centrifuger stérile de 2 ml avec joint torique.

Manipulation, entreposage et expédition des spécimens:

Entreposer les échantillons de sang au réfrigérateur jusqu'à ce qu'ils soient expédiés aux fins d'analyse. Entreposer les échantillons de tissu et le LCR au congélateur jusqu'à ce qu'ils soient expédiés aux fins de test. Entreposer les cultures bactériennes au réfrigérateur jusqu'à ce qu'elles soient expédiées aux fins de test.

Transport des marchandises dangereuses:

L'expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d'information sur la catégorisation des matières à des fins d'expédition, veuillez consulter la partie 2 de l'appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l'IATA sur les produits dangereux.

Pour obtenir des renseignements supplémentaires dans d’autres langues sur le transport de matières infectieuses, cliquez sur le lien ci-dessous.

http://www.who.int/ihr/capacity-strengthening/infectious-substances/fr/

 

Critères relatifs aux patients:

Infection de Bacillus anthracis soupconnée.

Documents d'accompagnement:

Requête pour l'élaboration d'épreuves et diagnostic – microbiologie médicolégale complétée incluant le nom, l'adresse et le numéro de téléphone de l'expéditeur. Nom du patient ou identifiant (# du laboratoire qui le réfère), date de naissance, exposition présumée, test(s) demandé(s), histoire clinique. Type de spécimen et date de prélèvement. Si possible, inclure les antibiotiques administrés et les antécédents de voyage.

Commentaires:

S/O

Méthodes et interprétation des résultats:

La PCR en temps réel est réalisée en des épreuves internes de différenciation moléculaire visant les régions pXO1 et pXO2 de Bacillus anthracis, ainsi qu’une cible chromosomique de Bacillus anthracis.

Parmi les tests de confirmation d’un échantillon dont les résultats de PCR en temps réel sont positifs pour Bacillus anthracis, il peut y avoir lyse par bactériophage gamma, test de motilité, test de sensibilité à la pénicilline, l’analyse des polymorphismes mononucléotidiques (SNP), analyse multilocus du polymorphisme des séquences répétées en tandem (MLVA), et l'identification de bactéries par spectrométrie de masse à temps de vol à désorption-ionisation par impact laser assistée par matrice (SM TOF MALDI).

Tous les échantillons dont les résultats de PCR en temps réel sont négatifs pour Bacillus anthracis sont soumis à une analyse des AGC et à un séquençage du gène codant l’ARNr 16S, pourvu que l’échantillon permette d’étudier la croissance bactérienne par culture.

Délai d'exécution:

4 jours civils pour l’obtention d’un résultat préliminaire; 14 jours civils pour l’obtention d’un résultat final; 28 jours pour toute demande d’analyse d’échantillons non standards ou spécialisés.

Coordonnées:
Téléphone: (204) 784-5928 or 1-877-212-6108
Télécopieur: (204) 789-5009
Références:
  1. Tracz, D.M., McCorrister, S.J., Westmacott, G.R., Corbett, C.R., 2012.  Effect of gamma radiation on the identification of bacterial pathogens by MALDI-TOF MS. J. Microbiol. Methods 92, 132-134.
Renseignements connexes: