Analyse multilocus du polymorphisme des séquences répétées en tandem (MLVA) et polymorphismes mononucléotidiques (SNP)

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Accrédité par le Conseil canadien des normes au laboratoire numéro 594 (ISO/IEC 17025)

Formulaires de demande

Détails de la référence

Description:

Approche multidimensionnelle du typage moléculaire des souches de Bacillus anthracis.

Test MLVA : Afin de déterminer les liens de parenté entre les souches, typage faisant appel à la PCR, puis à l’analyse de la taille des fragments de 15 loci.

Test SNP : Typage moléculaire des souches de Bacillus anthracis afin de déterminer les variations génétiques entre les membres d’une espèce.

Catégorie d'analyse:
Différenciation moléculaire
Agent pathogène:
Bacillus anthracis
Infections et maladies:
  • Anthrax
Spécimen:

Culture pure, sang total – volume minimum requis 0.5 mL, liquide céphalo-rachidien (LCR) – volume minimum requis 0.5 mL, tissu de la biopsie, poudre. Culture bactérienne pure – plaque ou écouvillon; Sang total – tube EDTA; Tissu ou LCR – soumettre dans un tube à prélèvement stérile; poudre – soumettre dans un microtube à centrifuger stérile de 2 ml avec joint torique.

Méthode de prélèvement:

Culture bactérienne pure – plaque ou écouvillon.

Manipulation, entreposage et expédition des spécimens:

Entreposer les cultures bactériennes au réfrigérateur jusqu'à ce qu'elles soient expédiées aux fins de test.

Transport des marchandises dangereuses:

L'expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d'information sur la catégorisation des matières à des fins d'expédition, veuillez consulter la partie 2 de l'appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l'IATA sur les produits dangereux.

Pour obtenir des renseignements supplémentaires dans d’autres langues sur le transport de matières infectieuses, cliquez sur le lien ci-dessous.

http://www.who.int/ihr/capacity-strengthening/infectious-substances/fr/

 

Critères relatifs aux patients:

Infection confirmée à Bacillus anthracis

Documents d'accompagnement:

Requête pour l'élaboration d'épreuves et diagnostic – microbiologie médicolégale complétée incluant le nom, l'adresse et le numéro de téléphone de l'expéditeur. Nom du patient ou identifiant (# du laboratoire qui le réfère), date de naissance, exposition présumée, test(s) demandé(s), histoire clinique. Type de spécimen et date de prélèvement. Si possible, inclure les antibiotiques administrés et les antécédents de voyage.

Commentaires:

S/O

Méthodes et interprétation des résultats:

Test MLVA : Le profil MLVA sera établi par PCR suivie de la mesure des fragments résultants par électrophorèse capillaire. Toute correspondance avec des isolats contenus dans des banques de données existantes sera communiquée au client.

Test SNP : La PCR permettra de définir le profil SNP; les mutations qui touchent une seule paire de bases dans un locus en particulier, habituellement composé de deux allèles, seront recherchées. 

Délai d'exécution:

14 jours civils pour un résultat final.

Coordonnées:
Téléphone: (204) 784-5928 or 1-877-212-6108
Télécopieur: (204) 789-5009
Références:
  1. Keim, P, 2008 Real-Time PCR, plcR and Canonical SNP Genotyping of Bacillus anthracis. V04.29.08
  2. M.N. Van Ert, WR Easterday, et al. 2007. Global Genetic Population Structure of Bacillus anthracis. PLoS ONE. 2(5): e461.
Renseignements connexes: