Sous-typage génomique

Sous-typage génomique de Campylobacter spp.

Isolat obtenu à partir des urines, des selles, du sang, de l’environnement, d’un aliment, etc.

Isolat fourni sur un milieu de culture approprié avec croissance visible.

Envoyer sur un milieu de culture ensemencé ou sur un milieu de transport approprié. Le récipient de culture doit être étanche ou adéquatement scellé.

L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.

Gastro-entérite, septicémie, infection ou autres.

Formulaire de requête d’analyse pour le Programme des maladies entériques dûment rempli.

S/O

Analyse MLST du génome entier (Campylobacter jejuni et Campylobacter coli seulement)

Analyse SNV du génome entier (toutes les espèces du genre Campylobacter)

Les données de séquençage du génome entier sont transmises aux bases de données nationales de PulseNet Canada afin d'être interprétées conformément aux directives de PulseNet Canada. Veuillez nous contacter en utilisant les coordonnées ci-dessous pour obtenir de plus informations sur les directives d'interprétation.

Les tests sont effectués, en totalité ou en partie, au moyen

21 jours civils pour les échantillons reçus au LNM. 5 jours civils pour l’analyse des données de SGE reçues au LNM. À noter : Les délais d’exécution pour les isolats de routine peuvent être prolongés durant une éclosion majeure de toxiinfections alimentaires ou en raison d’une disponibilité limitée de ressources.