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Sous-typage génomique

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*Accrédité par le Conseil canadien des normes au laboratoire numéro 594 (ISO/IEC 17025).

Formulaires de demande

Détails de la référence

Description:

Sous-typage génomique de Campylobacter spp.

Catégorie d'analyse:
Différenciation moléculaire
Agent pathogène:
Campylobacter spp.
Laboratoire:
Infections et maladies:
  • Campylobactériose
Spécimen:

Isolat obtenu à partir des urines, des selles, du sang, de l’environnement, d’un aliment, etc.

Méthode de prélèvement:

Isolat fourni sur un milieu de culture approprié avec croissance visible.

Manipulation, entreposage et expédition des spécimens:

Envoyer sur un milieu de culture ensemencé ou sur un milieu de transport approprié.

Transport des marchandises dangereuses:

L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.

 

Critères relatifs aux patients:

Gastro-entérite, septicémie, infection ou autres.

Documents d'accompagnement:

Formulaire de requête d’analyse pour le Programme des maladies entériques dûment rempli.

Commentaires:

S/O

Méthodes et interprétation des résultats:

*Analyse MLST du génome entier (Campylobacter jejuni et Campylobacter coli seulement)

Les tests sont effectués, en totalité ou en partie, au moyen d’une trousse d’analyse destinée à des fins de recherche seulement et qui n’a pas été entièrement validée ni vérifiée, car il n’y a pas de panel bien caractérisé.

Analyse SNV du génome entier (toutes les espèces du genre Campylobacter)

Les tests sont effectués, en totalité ou en partie, au moyen d’une trousse d’analyse destinée à des fins de recherche seulement et qui n’a pas été entièrement validée ni vérifiée.

Les données seront acheminées à la section Surveillance, détection des éclosions et intervention du LNM, qui interprétera les données conformément aux lignes directrices du Réseau PulseNet Canada. Veuillez utiliser l’information ci-dessous pour communiquer avec nous en vue d’obtenir plus de renseignements sur les lignes directrices relatives à l’interprétation des données.

Délai d'exécution:

21 jours civils pour le séquen¿age du génome entier effectué à l’interne.  5 jours civils pour l’analyse des échantillons séquencés à l'échelle provincial.  À noter : Les délais d’exécution pour les isolats de routine peuvent être prolongés durant une éclosion majeure de toxiinfections alimentaires ou en raison d’une disponibilité limitée de ressources.

Coordonnées:
Téléphone: (204) 784-4827
Télécopieur: (204) 789-5012
Références: