Détection moléculaire et génotypage par séquençage
<<Retourner au laboratoireL'accréditation du test de détection est en attente de la finalisation d'une évaluation de modification du champ d'application. Le génotypage est accrédité par le Conseil canadien des normes selon la norme ISO/IEC 17025 (dossier n° 15734).
Formulaires de demande
Détails de la référence
Détection moléculaire de la chlamydia LGV sur des échantillons confirmés positifs pour C. trachomatis et génotypage par séquençage direct.
- Lymphogranulome vénérien (LGV)
Culture positive à la chlamydia ou résultats positifs issus de prélèvements rectaux, endocervicaux, urétraux, d'urine ou de biopsies, ainsi que d'échantillons conservés dans un tampon (tels que le tampon Roche Cobas CTNG, le tampon APTIMA, le tampon Alinity ou le tampon BD Max). D'autres types d'échantillons peuvent être pris en compte sur demande. Le volume minimum requis est de 1 ml.
Écouvillon ou brosses cytologiques.
Placer les brosses cytologiques ou les écouvillons dans 2 mL de milieu de transport. Les échantillons peuvent être conservés et expédiés réfrigérés au LNM dans les 48 h suivant le prélèvement, sinon, ils doivent être conservés et expédiés congelés. Les pièces de biopsie fraîches doivent être conservées au congélateur en tout temps et expédiées sur de la glace sèche.
L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.
Ce service est proposé uniquement pour les cas suspects de LGV sur la base d’échantillons positifs pour C. trachomatis.
Formulaire de demande « Infections sexuellement transmissibles et opportunistes » dûment rempli, comprenant le nom, l'adresse et le numéro de téléphone du laboratoire expéditeur, l'identifiant du patient, sa date de naissance ou son âge, son sexe, le numéro de référence de l'échantillon, le type d'échantillon, la date de prélèvement, le test demandé, le type de tampon, la raison du test et toute autre information clinique pertinente.
Veuillez contacter le laboratoire si vous souhaitez utiliser un formulaire de demande au format Excel pour faciliter l'envoi groupé d'échantillon.
S/O
La détection du LGV dans les échantillons positifs pour Chlamydia trachomatis est réalisée par un test PCR multiplex en temps réel effectué en interne. La sensibilité analytique pour la détection du LGV se situe entre 5 et 50 copies/réaction. Le sérovar est confirmé par amplification et séquençage du gène ompA.
Veuillez noter que cette méthode est moins sensible que la détection par NAAT de la CT.
10 jours calendaires pour la détection du LGV et 21 jours calendaires pour le génotypage du LGV. Veuillez contacter le laboratoire pour vous renseigner sur des délais d'exécution plus courts.
- Smit PW, Cornelissen AR, Bruisten SM (2020) Reduction of non-typeable results using a plasmid oriented Lymfogranuloma venereum PCR for typing of Chlamydia trachomatis positive samples. PLoS ONE 15(6): e0233990. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0233990
- Chen CY, Chi KH, Alexander S, Ison CA, Ballard RC. A real-time quadriplex PCR assay for the diagnosis of rectal lymphogranuloma venereum and non-lymphogranuloma venereum Chlamydia trachomatis infections. Sex Transm Infect. 2008 Aug;84(4):273-6. https://doi.org/10.1136/sti.2007.029058