Détection moléculaire par PCR

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Détails de la référence

Description:

Détection de Chlamydophila pneumoniae par PCR.

Catégorie d'analyse:
Détection moléculaire
Agent pathogène:
Chlamydophila pneumoniae
Infections et maladies:
  • Pneumonie atypique
Spécimen:

Lavage bronchoalvéolaire ou biopsie pulmonaire. Il nous est également possible d’analyser des échantillons d’aspirats nasopharyngés, d’expectorations et de liquide céphalorachidien, mais ce type d’échantillon n’est pas idéal pour l’analyse. Les écouvillons secs ne seront pas acceptés pour l’analyse; les écouvillons doivent toujours être envoyés dans le milieu de conservation approprié. Fournir au moins 1,0 ml d’échantillon liquide.  Tous les échantillons devraient, de préférence, être envoyés dans des tubes à bouchon vissé faits de plastique résistant aux chocs et à la congélation-décongélation.

Méthode de prélèvement:

Suivre les méthodes d'échantillonnage aseptique normalisées au moment du prélèvement des échantillons et veiller à ce que le matériel clinique soit placé dans le milieu de conservation approprié.

Manipulation, entreposage et expédition des spécimens:

Le laboratoire expéditeur n’a aucun traitement supplémentaire à effectuer lorsque les échantillons sont prélevés selon les directives énoncées ci-dessus. Il est préférable de congeler les échantillons immédiatement après leur prélèvement. Si c’est impossible, ils doivent être conservés à une température de réfrigération (2 °C à 8 °C).  Veiller à ce que les échantillons soient maintenus à la bonne température durant leur expédition au LNM (p. ex. les échantillons congelés doivent être expédiés sur de la glace sèche et les échantillons réfrigérés sur des blocs réfrigérants).

Transport des marchandises dangereuses:

L'expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d'information sur la catégorisation des matières à des fins d'expédition, veuillez consulter la partie 2 de l'appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l'IATA sur les produits dangereux.

Pour obtenir des renseignements supplémentaires dans d’autres langues sur le transport de matières infectieuses, cliquez sur le lien ci-dessous.

http://www.who.int/ihr/capacity-strengthening/infectious-substances/fr/

 

Critères relatifs aux patients:

Les symptômes d'infection respiratoire (p. ex. bronchite et pneumonie atypique) évoquent une infection à C. pneumoniae. Cependant, cette dernière a aussi été associée à d'autres affections telles que les coronaropathies, l'asthme et la sarcoïdose1.

Documents d'accompagnement:

Requête d’analyse de bactériologie spéciale dûment remplie, comprenant les renseignements sur le patient et l’information clinique pertinente. Si possible, joindre les résultats des tests de laboratoire effectués par le laboratoire local et/ou provincial. 

 

Commentaires:

Si le résultat d'une analyse effectuée par le laboratoire expéditeur est positif pour C. pneumoniae, il serait utile de l'indiquer dans les documents d'accompagnement, en précisant le type d'analyse.

Méthodes et interprétation des résultats:

L’ADN de tous les échantillons de C. pneumoniae reçus au LNM à des fins d’analyse par PCR est d’abord extrait à l’aide d’une trousse disponible sur le marché. Les résultats sont fondés sur une PCR en temps réel ciblant le gène argR de C. pneumoniae, à savoir le gène conservé codant la protéine de répression de l’arginine.

Délai d'exécution:

10 jours civils.  Il est important de noter que lorsqu’un grand nombre d’échantillons est reçu ou lorsque des tests doivent être répétés, le délai d’exécution peut être plus long.

Coordonnées:
Téléphone: (204) 789-2137
Télécopieur: (204) 784-7509
Références:
  1. Thurman, K. A., Warner, A. K., Cowart, K. C., Benitez, A. J., & Winchell, J. M. (2011). Detection of Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae, and Legionella spp. in clinical specimens using a single-tube multiplex real-time PCR assay. Diagnostic microbiology and infectious disease, 70(1), 1-9.
Fiches d'information:
Lignes directrices:
Renseignements connexes: