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Identification

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*Accrédité par le Conseil canadien des normes au laboratoire numéro 594 (ISO/IEC 17025)

Formulaires de demande

Détails de la référence

Description:

Identification d’Escherichia coli présumée.

Catégorie d'analyse:
Identification phénotypique et moléculaire
Agent pathogène:
Escherichia coli
Infections et maladies:
  • Gastro-entérite
  • Septicémie
  • Bactériémie
  • Méningite néonatale
Spécimen:

Isolat obtenu à partir des urines, des selles, du sang, de l’environnement, d’un aliment, etc.

Méthode de prélèvement:

Isolat fourni sur un milieu de culture approprié pour E. coli.

Manipulation, entreposage et expédition des spécimens:

Envoyer sur un milieu de culture ensemencé ou sur un milieu de transport approprié.  Le récipient de culture doit être étanche ou adéquatement scellé.

Transport des marchandises dangereuses:

L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.

 

Critères relatifs aux patients:

Gastro-entérite, septicémie, infection ou autres.

Documents d'accompagnement:

Formulaire de requête d’analyse pour le Programme des maladies entériques dûment rempli.

Commentaires:

S/O

Méthodes et interprétation des résultats:

Identification phénotypique (biotypage)* (1)

Séquençage du gène codant l’ARNr 16S (2)

MALDI-TOF (3)

** Tous les isolats d’E. coli feront l’objet d’un séquençage du génome entier et d’un sérotypage, à moins d’indication contraire. **

  1. Biotypage selon Murray, P.R., Baron, E.J., Jorgensen, J.H., Pfaller, M.A., Yolken, R.H., Manual of Clinical Microbiology. 2003. ASM Press. Washington, DC. USA
  2. Comparaison des séquences à celles de la base de données d’ADNr 16S du NCBI et regroupement (formation de grappes) au moyen du logiciel BioNumerics.
  3. Analyse des résultats de MALDI-TOF à l’aide de la base de données Bruker Biotyper la plus récente.
Délai d'exécution:

21 jours civils.  À noter : Les délais d’exécution pour les isolats de routine peuvent être prolongés durant une éclosion majeure de toxiinfections alimentaires ou en raison d’une disponibilité limitée de ressources.

Coordonnées:
Téléphone: (204) 789-6009
Télécopieur: (204) 789-5012
Références: