Détection moléculaire de Francisella tularensis par PCR en temps réel
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Formulaires de demande
Détails de la référence
Détection moléculaire de Francisella tularensis par PCR en temps réel.
- Tularémie
Culture pure, sang total – volume minimum requis 0.5 mL, liquide céphalo-rachidien (LCR) – volume minimum requis 0.5 mL, tissus de biopsie frais, poudre.
Culture bactérienne pure – plaque ou écouvillon; Sang total – tube EDTA; Tissu ou LCR – soumettre dans un tube à prélèvement stérile; poudre – soumettre dans un microtube à centrifuger stérile de 2 ml avec joint torique.
Entreposer les cultures bactériennes au réfrigérateur jusqu’à ce qu’elles soient expédiées aux fins de test. Entreposer les échantillons de sang au réfrigérateur jusqu’à ce qu’ils soient expédiés aux fins d’analyse. Entreposer les échantillons de tissu et le LCR au congélateur jusqu’à ce qu’ils soient expédiés aux fins de test.
L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.
Infection de Francisella tularensis soupconnée.
Requête pour L’Élaboration d’épreuves et diagnostic – microbiologie médicolégale complétée incluant le nom, l’adresse et le numéro de téléphone de l’expéditeur. Nom ou identifiant du patient (no du laboratoire demandeur), date de naissance, exposition présumée, test(s) demandé(s), antécédents cliniques, antécédents de voyage, type d’échantillon et date de prélèvement.
Veuillez aviser le laboratoire avant d’envoyer l’échantillon.
La PCR en temps réel est réalisée en utilisant des épreuves internes de différenciation moléculaire avec trois cibles spécifiques de Francisella tularensis. Une de ces trois cibles permet de faire une distinction entre les souches de type A et les souches de type B.
Parmi les tests de confirmation d’un échantillon dont les résultats de PCR en temps réel sont positifs pour F. tularensis il peut y avoir l’épreuve d’immunofluorescence directe, l’analyse des polymorphismes mononucléotidiques (SNP), séquençage du génome entier (WGS), et identification de bactéries par spectrométrie de masse à temps de vol à désorption-ionisation par impact laser assistée par matrice (SM TOF MALDI).
Tous les échantillons dont les résultats de PCR en temps réel sont négatifs pour F. tularensis sont soumis à SM TOF MALDI, pourvu que l’échantillon permette d’étudier la croissance bactérienne par culture.
4 jours civils pour l’obtention d’un résultat préliminaire; 14 jours civils pour l’obtention d’un résultat final; 28 jours civils pour toute demande d’analyse d’échantillons non standards ou spécialisés.
- Tracz, DM, et al. 2012. Effect of gamma radiation on the identification of bacterial pathogens by MALDI-TOF MS. J. Microbiol. Methods 92, 132-134.