Génotypage par analyse de la séquence

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Formulaires de demande

Détails de la référence

Description:

Génotypage du virus de l’hépatite A à l’aide d’une RT-PCR conventionnelle suivi du séquençage de l’ADN.

Catégorie d'analyse:
Génotypage
Agent pathogène:
Virus de l’hépatite A (VHA)
Infections et maladies:
  • Hépatite A
Spécimen:

Sérum, plasma ou échantillon de selles.  Volume minimum requis pour le sérum ou le plasma est de 1.0 mL ou environ 1.0 gramme de selles pour préparer une suspension contenant 20% de selles.

Méthode de prélèvement:

Prélever le sang dans des tubes de séparation du sérum (TSS) ou tubes EDTA.  Prélever l’échantillon de selles et congeler. Optionnel : préparer une suspension contenant 20% de selles et congeler immédiatement.

Manipulation, entreposage et expédition des spécimens:

Congeler les échantillons jusqu’au moment de leur envoi pour analyse. Expédier les échantillons congelés sur glace sèche.

Transport des marchandises dangereuses:

L'expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d'information sur la catégorisation des matières à des fins d'expédition, veuillez consulter la partie 2 de l'appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l'IATA sur les produits dangereux.

Pour obtenir des renseignements supplémentaires dans d’autres langues sur le transport de matières infectieuses, cliquez sur le lien ci-dessous.

http://www.who.int/ihr/capacity-strengthening/infectious-substances/fr/

 

Critères relatifs aux patients:

Infection par le virus de l’hépatite A présumée. Le résultat sérologique doit être positif aux IgM anti-VHA.

Documents d'accompagnement:

Requête pour des hépatites virales et pathogènes transmis par le sang complétée incluant le nom, l’adresse et le numéro de téléphone de l’expéditeur.  Le nom du patient ou l’identificateur (# du laboratoire qui le réfère), la date de naissance, l’exposition présumée, le(s) test(s) demandé(s). Nature du spécimen et date de prélèvement. Si possible, fournir l’histoire clinique et les résultats d’analyses qui ont été effectuées par les laboratoires locaux ou provinciaux.

Commentaires:

S/O

Méthodes et interprétation des résultats:

Amplification par RT-PCR conventionnelle de la jonction VP1/2A suivi du séquençage.

Délai d'exécution:

19 jours civils.

Coordonnées:
Téléphone: (204) 789-6061; HCV (204) 789-5063
Télécopieur: (204) 789-2082
Références:
  1. Kroneman A, de Sousa R, Verhoef L, et al., Usability of the international HAVNet hepatitis A virus database for geographical annotation, backtracing and outbreak detection. Euro Surveill. 2018 23(37): 1700802.