Génotypage par analyse de la séquence
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Détails de la référence
Génotypage du virus de l’hépatite B par analyse de la séquence.
- Hépatite B
Échantillon de sérum ou de plasma. Volume minimum requis pour le sérum ou le plasma: 1,0 mL.
Prélever le sang dans des tubes de séparation du sérum (TSS) ou tubes EDTA.
Congeler les échantillons jusqu'au moment de leur envoi pour analyse. Expédier les échantillons congelés sur glace sèche.
L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.
Infection par le virus de l’hépatite B présumée. Les résultats sérologiques doivent indiquer les marqueurs du virus de l’hépatite B et les résultats de l’ADN du VHB doivent être positifs (i.e., charge virale détectable).
Requête pour des hépatites virales et pathogènes transmis par le sang complétée incluant le nom, l’adresse et le numéro de téléphone de l’expéditeur. Le nom du patient ou l’identificateur (# du laboratoire qui le réfère), la date de naissance, l’exposition présumée, le(s) test(s) demandé(s). Nature du spécimen et date de prélèvement. Si possible, fournir l’histoire clinique et les résultats d’analyses qui ont été effectuées par les laboratoires locaux ou provinciaux.
Les tests répétés pour le génotype du virus de l’hépatite B (VHB) chez les personnes atteintes d’une hépatite B chronique ne sont pas nécessaires à moins que l’on suspecte une surinfection.
PCR classique suivie d’une analyse de séquence et phylogénétique comparée aux séquences des génotypes de référence du VHB.
19 jours civils.
- McNaughton AL, Revill PA, Littlejohn M, Matthews PC, Ansari MA. Analysis of genomic-length HBV sequences to determine genotype and subgenotype reference sequences. J Gen Virol 2020 101(3):271-283.