Génotypage par analyse de la séquence

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Formulaires de demande

Détails de la référence

Description:

Génotypage du virus de l’hépatite B par analyse de la séquence.

Catégorie d'analyse:
Génotypage
Agent pathogène:
Virus de l’hépatite B (VHB)
Infections et maladies:
  • Hépatite B
Spécimen:

Échantillon de sérum ou de plasma. Volume minimum requis pour le sérum ou le plasma: 1,0 mL.

Méthode de prélèvement:

Prélever le sang dans des tubes de séparation du sérum (TSS) ou tubes EDTA.

Manipulation, entreposage et expédition des spécimens:

Congeler les échantillons jusqu'au moment de leur envoi pour analyse. Expédier les échantillons congelés sur glace sèche.

Transport des marchandises dangereuses:

L'expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d'information sur la catégorisation des matières à des fins d'expédition, veuillez consulter la partie 2 de l'appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l'IATA sur les produits dangereux.

Pour obtenir des renseignements supplémentaires dans d’autres langues sur le transport de matières infectieuses, cliquez sur le lien ci-dessous.

http://www.who.int/ihr/capacity-strengthening/infectious-substances/fr/

 

Critères relatifs aux patients:

Infection par le virus de l’hépatite B présumée.  Les résultats sérologiques doivent indiquer les marqueurs du virus de l’hépatite B et les résultats de l’ADN du VHB doivent être positifs (charge virale détectable).

Documents d'accompagnement:

Requête pour des hépatites virales et pathogènes transmis par le sang complétée incluant le nom, l’adresse et le numéro de téléphone de l’expéditeur.  Le nom du patient ou l’identificateur (# du laboratoire qui le réfère), la date de naissance, l’exposition présumée, le(s) test(s) demandé(s). Nature du spécimen et date de prélèvement. Si possible, fournir l’histoire clinique et les résultats d’analyses qui ont été effectuées par les laboratoires locaux ou provinciaux.

Commentaires:

S/O

Méthodes et interprétation des résultats:

PCR classique suivie d’une analyse de séquence et d’une analyse phylogénétique comparée aux séquences des génotypes de référence du VHB.

Délai d'exécution:

19 jours civils.

Coordonnées:
Téléphone: (204) 789-6061; HCV (204) 789-5063
Télécopieur: (204) 789-2082
Références:
  1. Osiowy C, and Giles E. Evaluation of the INNO-LiPA HBV genotyping assay for determination of hepatitis B virus genotype. J Clin Microbiol 2003. 41:5473-5477.
  2. Pourkarim MR, Amini-Bavil-Olyaee S, Kurbanov F, Van Ranst M, and Tacke F. Molecular identification of hepatitis B virus genotypes/subgenotypes: Revised classification hurdles and updated resolutions. World J Gastroenterol 2014. 20:7152-7168.