Génotypage par analyse de la séquence
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Détails de la référence
Génotypage du virus de l'hépatite Delta à l'aide d'une épreuve RT-PCR conventionnelle suiviedu séquençage de l'ADN.
- Hépatite D
Échantillon de sérum ou de plasma. Volume minimum requis pour le sérum ou le plasma: 1,0 mL.
Prélever le sang dans des tubes de séparation du sérum (TSS) ou tubes EDTA.
Congeler les échantillons jusqu'au moment de leur envoi pour analyse. Expédier les échantillons congelés sur glace sèche.
L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.
Infection par le virus de l'hépatite Delta présumée. Les résultats sérologiques doivent indiquer les marqueurs du virus de l'hépatite Delta (IgG anti-VHD).
Requête pour des hépatites virales et pathogènes transmis par le sang complétée incluant le nom, l’adresse et le numéro de téléphone de l’expéditeur. Le nom du patient ou l’identificateur (# du laboratoire qui le réfère), la date de naissance, l’exposition présumée, le(s) test(s) demandé(s). Nature du spécimen et date de prélèvement. Si possible, fournir l’histoire clinique et les résultats d’analyses qui ont été effectuées par les laboratoires locaux ou provinciaux.
Les tests répétés pour le génotype du virus de l’hépatite D (VHD) chez les personnes atteintes d’une hépatite D chronique ne sont pas nécessaires à moins que l’on suspecte une surinfection ou une réinfection.
PCR en temps réel classique du petit antigène du VHD région de codage suivie d’une analyse de séquence et d’une analyse phylogénétique comparée aux séquences des génotypes de référence du VHD.
19 jours civils.
- Dény P. Hepatitis delta virus genetic variability: from genotypes I, II, III to eight major clades? Curr Top Microbiol Immunol. 2006;307:151-71.
- Theamboonlers A, Hansurabhanon T, Verachai V, Chongsrisawat V, Poovorawan Y. Hepatitis D virus infection in Thailand: HDV genotyping by RT-PCR, RFLP and direct sequencing. Infection. 2002 Jun;30(3):140-4.