Génotypage avec la technologie du Luminex - types muqueux

Génotypage par un test Luminex interne pour les papillomavirus humains des muqueuses.

Échantillons génitaux, anaux ou oropharyngés, et biopsies. D’autres types d’échantillons peuvent être acceptés sur demande. Pas de verrues génitales. Le volume minimum requis est de 1/4 de l’échantillon prélevé, soit 1,0 ml. Pour les tissus fixés, veuillez envoyer 5 coupes ou le bloc entier. Veuillez consulter les critères relatifs aux patients ci-dessous pour l’envoi d’échantillons de lésions muqueuses.

Cytobrosses cervicales dans des solutions ThinPrep PreservCyt ou Surepath. Écouvillons pour les échantillons génitaux, anaux et oropharyngés dans un milieu de transport. Écouvillons pour les condylomes acuminés ou autres lésions visibles dans un milieu de transport. Biopsie fraîche ou tissu fixé de toute lésion.

Placez les écouvillons dans un milieu de transport et fournissez l'échantillon prélevé dans son intégralité, ou au moins 1,0 ml d'échantillon. Les échantillons prélevés par cytobrosse et écouvillon peuvent être conservés et expédiés réfrigérés (4 °C) au NML dans les 48 heures suivant le prélèvement, ou doivent être conservés et expédiés congelés. Les biopsies fraîches doivent toujours être conservées congelées et expédiées sur de la glace carbonique. Les tissus fixés peuvent être conservés et expédiés à température ambiante.

L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.

Ce service est proposé à titre de référence et de confirmation uniquement lorsque le génotypage du VPH est nécessaire pour confirmer un diagnostic de cancer ou de lésions oropharyngées. Ce test n’est pas adapté au dépistage du cancer du col de l’utérus lié au VPH. Les échantillons destinés au dépistage de routine du cancer du col de l’utérus, au triage ASCUS ou au diagnostic différentiel des verrues génitales ne sont pas acceptés, sauf s’ils s’inscrivent dans le cadre d’une étude collaborative préalablement convenue.

Veuillez décrire le site anatomique, le type de lésion, le type d’échantillon et la raison du test. Ces informations sont nécessaires pour évaluer si les demandes relèvent de notre mandat. Ce test ne détecte pas les types de VPH responsables des verrues communes et d’autres lésions cutanées.

Formulaire de demande « Infections sexuellement transmissibles et opportunistes » dûment rempli, comprenant le nom, l'adresse et le numéro de téléphone du laboratoire expéditeur, l'identifiant du patient, sa date de naissance ou son âge, son sexe, le numéro de référence de l'échantillon, le site anatomique, le type d'échantillon, le type de lésion, la date de prélèvement, le test demandé, la raison du test et toute autre information clinique pertinente.

S/O

Le test interne consiste en une PCR nichée suivie d’un génotypage utilisant la technologie Luminex (1). Le ou les types précis de VPH sont indiqués. La présence de types supplémentaires autres que ceux testés ne peut être exclue. La limite de détection se situe entre 10 et 100 copies pour la plupart des types de VPH muqueux. Ce test cible l’ADN L1 pour les types de VPH suivants, présentant des degrés de risque variables de carcinomes (2) : 6, 11, 13, 16, 18, 26, 30, 31, 32, 33, 35, 39, 40, 42, 43, 44, 45, 51, 52, 53, 54, 56, 58, 59, 61, 62, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 89, 90, 91 et 97. Veuillez noter que lors de l’analyse d’échantillons fixés au formol, la présence du VPH peut ne pas être détectée en raison de la sensibilité réduite du test. Les échantillons dont le résultat est négatif à l’aide du test Luminex interne seront retestés à l’aide d’un test commercial validé ciblant l’ADN du VPH E6/E7, afin de tenir compte d’une éventuelle perturbation de L1 due à des événements d’intégration du VPH. Les échantillons provenant de cancers invasifs confirmés, qui se sont révélés négatifs aux deux tests, feront l'objet d'une analyse complémentaire par séquençage de nouvelle génération (SNG) (3,4).

14 jours calendaires. Ce délai d'exécution ne s'applique pas aux échantillons traités par SNG. Veuillez contacter le laboratoire pour vous renseigner sur les délais d'exécution.

1. Zubach, V., Smart, G., Ratnam, S., Severini, A. 2011. Novel microsphere-based method for the detection and typing of 46 mucosal human papillomavirus types. J. Clin Microbiol. 50(2): 460-4.
2. Arroyo, L S., Lagheden, C., Eklund, C., Dillner, J. 2009. Chapter 2 – Human Papillomavirus Types. Human Papillomavirus e-Laboratory Manual (1st Edition). 5.
3. Arroyo ühr, L S., Lagheden, C., Eklund, C., Lei, J., Nordqvist-Kleppe, S., Sparén, P., Sundström, K., Dillner, J. 2020. Sequencing detects human papillomavirus in some apparently HPV-negative invasive cervical cancers. J. Gen Virol. 101:265-270.
4. Takara Bio USA, Inc. SMART-Seq® Total RNA Library Prep with ZapR® Depletion User Manual. Takarabio.com