Sous-typage génomique

Sous-typage génomique de Listeria spp.

Isolat obtenu à partir du sang, des urines, et d’une culture de liquide organique stérile, de l’environnement, d’un aliment, etc.

Isolat fourni sur un milieu de culture pour Listeria spp.

Envoyer sur un milieu de culture ensemencé ou sur un milieu de transport approprié.  Les échantillons cliniques doivent être expédiés conformément aux conditions d’expédition appropriées pour le type d’échantillon.

L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.

Septicémie, méningite, gastro-entérite, infections néonatales.

Formulaire de requête d’analyse pour le Programme des maladies entériques dûment rempli.

S/O

Analyse MLST du génome entier (L. monocytogenes seulement)

Analyse SNV du génome entier (toutes les espèces du genre Listeria)

Les données de séquençage du génome entier sont transmises aux bases de données nationales de PulseNet Canada afin d'être interprétées conformément aux directives de PulseNet Canada. Veuillez nous contacter en utilisant les coordonnées ci-dessous pour obtenir de plus informations sur les directives d'interprétation.

Les tests sont effectués, en totalité ou en partie, au moyen d’une trousse d’analyse destinée à des fins de recherche seulement et qui n’a pas été entièrement validée ni vérifié

21 jours civils pour le séquen¿age du génome entier effectué à l’interne 5 jours civils pour l’analyse des échantillons séquencés à l'échelle provincial. À noter : Les délais d’exécution pour les isolats de routine peuvent être prolongés durant une éclosion majeure de toxiinfections alimentaires ou en raison d’une disponibilité limitée de ressources.