Détection moléculaire du virus l'orthopoxvirose simienne
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Détails de la référence
Amplification PCR du génome du virus de l’orthopoxvirose simienne.
- Variole simienne/mpox
Liquide de lésion et/ou croûte, gale, matériel de peau, écouvillons ; LCR, autres liquides organiques (échantillon minimum 0,5 ml) et tissus frais congelés. Tissus fixés au formol et/ou inclus en paraffine
Prélever les échantillons dans des tubes stériles de 1,5 à 5,0 ml. Il est recommandé d’utiliser des écouvillons secs placés dans des tubes stériles, mais les échantillons conservés dans un milieu de transport sont acceptés si le milieu est précisé sur la demande.
Tissus : Les tissus frais congelés doivent être placés dans des récipients en plastique. Les tissus fixés au formol doivent également être envoyés dans des conteneurs en plastique et être clairement identifiés comme étant fixés au formol. Les tissus inclus en paraffine peuvent être envoyés en blocs entiers ou en quatre à six sections de 10 µm dans un tube ou un flacon en plastique.
Sérum : Recueillir dans des tubes à sérum (avec bouchon rouge) ou dans des tubes séparateurs de sérum (TSS). La centrifugation des tubes à sérum n’est pas nécessaire et doit en fait être évitée.
Conserver les échantillons au réfrigérateur ou au congélateur jusqu’à leur expédition pour analyse. Le sérum peut être expédié réfrigéré ou congelé. Les tissus doivent être expédiés congelés. Expédier des échantillons congelés sur de la glace sèche et les échantillons réfrigérés sur de la glace humide. Les échantillons fixés au formol peuvent être envoyés à température ambiante.
L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.
Symptomatique et rentre d’une région endémique ou exposition à des voyageurs ayant séjourné dans ces régions.
Requête d’Agents pathogènes spéciaux complétée incluant le nom, l’adresse et le numéro de téléphone de l’expéditeur. L’information chez le patient incluant le nom du patient ou identifiant, la date de naissance, et tout antécédent pertinent, y compris le diagnostic clinique, les maladies sous jacentes, le risque d’exposition et historique des déplacements. Indiquez le type d’échantillon prélevé et fournissez tous les renseignements sur les échantillons. Choisissez toutes les analyses requises. Dans la mesure du possible, annexez les résultats des tests de laboratoire déjà réalisés par un laboratoire local ou provincial.
Les antécédents du patient doivent être inclus; les échantillons non accompagnés d’antécédents suffisants pour justifier une analyse sont susceptibles d’être rejetés. Contactez le laboratoire des agents pathogènes spéciaux avant d’expédier des échantillons afin de vous assurer que les bons documents d’expédition ont été produits.
Le test PCR est validé. L’isolement du virus est une analyse spéciale effectuée à des fins d’enquête.
Dans le cas du diagnostic d’une infection par le virus de l’orthopoxvirose simienne en attente de confirmation, on doit obtenir un ou plusieurs résultats positifs concernant les marqueurs diagnostiques suivants : présence d’ADN du virus de l’orthopoxvirose simienne révélée par PCR et ii) présence du virus de l’orthopoxvirose simienne révélée par isolement.
2 jours civils.