Détection moléculaire par PCR
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Détails de la référence
Détection de Mycoplasma pneumoniae par PCR.
- Pneumonie atypique
Lavage bronchoalvéolaire (BAL), aspiration nasopharyngée (NPA) ou prélèvement de gorge. Les crachats, le liquide céphalo-rachidien (LCR) et les échantillons de tissus peuvent également être testés, mais ne sont pas idéaux. Les écouvillons secs ne seront pas acceptés pour l’analyse; les écouvillons doivent toujours être envoyés dans le milieu de conservation approprié. Fournir au moins 1.0 ml d’échantillon liquide. Tous les échantillons devraient, de préférence, être envoyés dans des tubes à bouchon vissé faits de plastique résistant aux chocs et à la congélation-décongélation.
Suivre les méthodes d'échantillonnage aseptique normalisées au moment du prélèvement des échantillons et veiller à ce que le matériel clinique soit placé dans le milieu de conservation approprié.
Le laboratoire expéditeur n’a aucun traitement supplémentaire à effectuer lorsque les échantillons sont prélevés selon les directives énoncées ci-dessus Il est préférable de congeler les échantillons immédiatement après leur prélèvement. Si c’est impossible, ils doivent être conservés à une température de réfrigération (2 °C à 8 °C). Veiller à ce que les échantillons soient maintenus à la bonne température durant leur expédition au LNM (p. ex. les échantillons congelés doivent être expédiés sur de la glace sèche et les échantillons réfrigérés sur des blocs réfrigérants).
L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.
Les caractéristiques cliniques de l'infection respiratoire à M. pneumoniae comprennent souvent une amygdalite, une rhinite, une bronchiolite ou une pneumonie atypique, mais des symptômes associés à d'autres systèmes peuvent être observés (neurologiques, rénaux, dermatologiques, ophtalmologiques, musculosquelettiques, hématologiques, cardiovasculaires et gastrointestinaux).
Requête d’analyse de bactériologie spéciale dûment remplie (la version la plus récente de la demande est requise), comprenant les renseignements sur le patient et l’information clinique pertinente. Si possible, joindre les résultats des tests de laboratoire qui ont déjà été effectués par le laboratoire local et/ou provincial.
Si le résultat d'une analyse effectuée par le laboratoire expéditeur est positif pour M. pneumoniae, il serait utile de l'indiquer dans les documents d'accompagnement, en précisant le type d'analyse.
L’ADN est extrait à l’aide d’une trousse disponible sur le marché. Les résultats sont basés sur une épreuve de PCR en temps réel ciblant le gène codant pour la toxine CARDS et spécifique de M. pneumoniae. Les échantillons qui génèrent un résultat positif sont soumis à une épreuve de PCR classique ciblant le gène de l’ARNr 16S de la famille Mycoplasmataceae, suivie d’une analyse de la séquence du gène.
10 jours civils. Il est important de noter que lorsqu’un grand nombre d’échantillons est reçu ou lorsque des tests doivent être répétés, le délai d’exécution peut être plus long
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