Détection moléculaire par PCR

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Détails de la référence

Description:

Détection de Mycoplasma pneumoniae par PCR.

Catégorie d'analyse:
Détection moléculaire
Agent pathogène:
Mycoplasma pneumoniae
Infections et maladies:
  • Pneumonie atypique
Spécimen:

Lavage bronchoalvéolaire ou biopsie pulmonaire. Il nous est également possible d’analyser des échantillons d’aspirats nasopharyngés, d’expectorations et de liquide céphalorachidien, mais ce type d’échantillon n’est pas idéal pour l’analyse. Les écouvillons secs ne seront pas acceptés pour l’analyse; les écouvillons doivent toujours être envoyés dans le milieu de conservation approprié. Fournir au moins 1,0 ml d’échantillon liquide.  Tous les échantillons devraient, de préférence, être envoyés dans des tubes à bouchon vissé faits de plastique résistant aux chocs et à la congélation-décongélation.

Méthode de prélèvement:

Suivre les méthodes d'échantillonnage aseptique normalisées au moment du prélèvement des échantillons et veiller à ce que le matériel clinique soit placé dans le milieu de conservation approprié.

Manipulation, entreposage et expédition des spécimens:

Le laboratoire expéditeur n’a aucun traitement supplémentaire à effectuer lorsque les échantillons sont prélevés selon les directives énoncées ci-dessus Il est préférable de congeler les échantillons immédiatement après leur prélèvement. Si c’est impossible, ils doivent être conservés à une température de réfrigération (2 °C à 8 °C).  Veiller à ce que les échantillons soient maintenus à la bonne température durant leur expédition au LNM (p. ex. les échantillons congelés doivent être expédiés sur de la glace sèche et les échantillons réfrigérés sur des blocs réfrigérants).

Transport des marchandises dangereuses:

L'expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d'information sur la catégorisation des matières à des fins d'expédition, veuillez consulter la partie 2 de l'appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l'IATA sur les produits dangereux.

Pour obtenir des renseignements supplémentaires dans d’autres langues sur le transport de matières infectieuses, cliquez sur le lien ci-dessous.

http://www.who.int/ihr/capacity-strengthening/infectious-substances/fr/

 

Critères relatifs aux patients:

Les caractéristiques cliniques de l'infection respiratoire à M. pneumoniae comprennent souvent une amygdalite, une rhinite, une bronchiolite ou une pneumonie atypique, mais des symptômes associés à d'autres systèmes peuvent être observés (neurologiques, rénaux, dermatologiques, ophtalmologiques, musculosquelettiques, hématologiques, cardiovasculaires et gastrointestinaux).

Documents d'accompagnement:

Requête d’analyse de bactériologie spéciale dûment remplie, comprenant les renseignements sur le patient et l’information clinique pertinente. Si possible, joindre les résultats des tests de laboratoire effectués par le laboratoire local et/ou provincial.

 

Commentaires:

Si le résultat d'une analyse effectuée par le laboratoire expéditeur est positif pour M. pneumoniae, il serait utile de l'indiquer dans les documents d'accompagnement, en précisant le type d'analyse.

Méthodes et interprétation des résultats:

L’ADN de tous les échantillons reçus au LNM à des fins d’analyse par PCR pour le M. pneumoniae est d’abord extrait à l’aide d’une trousse disponible sur le marché. Les résultats sont basés sur une épreuve de PCR en temps réel spécifique de M. pneumoniae. Les échantillons qui génèrent un résultat positif sont soumis à une épreuve de PCR classique ciblant le gène de l’ARNr 16S de la famille Mycoplasmataceae, suivie d’une analyse de la séquence du gène.

Délai d'exécution:

10 jours civils.  Il est important de noter que lorsqu’un grand nombre d’échantillons est reçu ou lorsque des tests doivent être répétés, le délai d’exécution peut être plus long

Coordonnées:
Téléphone: (204) 789-2137
Télécopieur: (204) 784-7509
Références:
  1. Sanchez-Vargas, FM and Gómez-Duarte OG.  2008.  Mycoplasma pneumoniae-an emerging extra-pulmonary pathogen. Clin Microbiol Infect. Feb;14(2):105-17.
  2. Lingappa JR, Lawrence W, West-Keefe S, Gautom R, and Cookson BT. 2002. Diagnosis of community-acquired pertussis infection: comparison of both culture and fluorescent-antibody assays with PCR detection using electrophoresis or dot blot hybridization.  J. Clin. Microbiol. 40(8):2908-12.
  3. van Kuppeveld FJ, van der Logt JT, Angulo, AF, van Zoest MJ, Quint WG, Niesters HG, Galama JM, Melchers WJ.  1992.  Genus- and species-specific identification of mycoplasmas by 16S rRNA amplification.  Appl. Env. Microbiol. 58(8): 2606 – 2615.
  4. Thurman, K. A., Warner, A. K., Cowart, K. C., Benitez, A. J., & Winchell, J. M. (2011). Detection of Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae, and Legionella spp. in clinical specimens using a single-tube multiplex real-time PCR assay. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease,70(1), 1-9. doi:10.1016/j.
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