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Identification

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*Accrédité par le Conseil canadien des normes au laboratoire numéro 594 (ISO/IEC 17025)

Formulaires de demande

Détails de la référence

Description:

Identification d’espèces du genre Salmonella présumées.

Catégorie d'analyse:
Identification phénotypique et moléculaire
Agent pathogène:
Salmonella spp.
Infections et maladies:
  • Gastro-entérite
  • Salmonellose
Spécimen:

Isolat obtenu à partir des urines, des selles, du sang, de l’environnement, d’un aliment, etc.

Méthode de prélèvement:

Isolat fourni sur un milieu de culture approprié pour Salmonella.

Manipulation, entreposage et expédition des spécimens:

Envoyer sur un milieu de culture ensemencé ou sur un milieu de transport approprié.  Le récipient de culture doit être étanche ou adéquatement scellé.

Transport des marchandises dangereuses:

L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.

 

Critères relatifs aux patients:

Gastro-entérite, septicémie, infection ou autres.

Documents d'accompagnement:

Formulaire de requête d’analyse pour la Division des maladies entériques dûment rempli.

Commentaires:

S/O

Méthodes et interprétation des résultats:

Identification phénotypique (biotypage)(1)

Ressource de typage in silico de Salmonella(SISTR)(2)

Méthode MALDI-TOF (3)

Des méthodes d’analyse fondées sur le séquençage du génome entier pourraient être utilisées.

  1. Biotypage selon Murray, P.R., Baron, E.J., Jorgensen, J.H., Pfaller, M.A., Yolken, R.H., Manual of Clinical Microbiology. 2003. ASM Press. Washington, DC. USA.
  2. Yoshida CE, Kruczkiewicz P, Laing CR, Lingohr EJ, Gannon VPJ, Nash JHE, et al. (2016) The Salmonella In Silico Typing Resource (SISTR): An Open Web-Accessible Tool for Rapidly Typing and Subtyping Draft Salmonella Genome Assemblies. PLoS ONE 11(1): e0147101. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0147101
  3. Analyse des résultats de MALDI-TOF à l’aide de la base de données Bruker Biotyper la plus récente.

*Remarque : Tous les isolats de Salmonella feront l’objet d’un séquençage du génome entier et d’un sérotypage in silico. Un sérotypage classique est également possible, mais le laboratoire demandeur doit en faire la demande explicite.**

Délai d'exécution:

21 jours civils.  À noter : Les délais d’exécution pour les isolats de routine peuvent être prolongés durant une éclosion majeure de toxiinfections alimentaires ou en raison d’une disponibilité limitée de ressources.

Coordonnées:
Téléphone: (204) 789-6009
Télécopieur: (204) 789-5012
Références: