Sous-typage génomique
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Détails de la référence
Sous-typage génomique de Salmonella spp.
- Gastro-entérite
- Salmonellose
Isolat obtenu à partir des urines, des selles, du sang, de l’environnement, d’un aliment, etc.
Isolat fourni sur un milieu de culture approprié pour Salmonella.
Envoyer sur un milieu de culture ensemencé ou sur un milieu de transport approprié. Le récipient de culture doit être étanche ou adéquatement scellé.
L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.
Gastro-entérite, septicémie, infection ou autres.
Formulaire de requête d’analyse pour le Programme des maladies entériques dûment rempli.
S/O
Analyse MLST du génome entier
Analyse SNV du génome entier
Les données de séquençage du génome entier sont transmises aux bases de données nationales de PulseNet Canada afin d'être interprétées conformément aux directives de PulseNet Canada. Veuillez nous contacter en utilisant les coordonnées ci-dessous pour obtenir de plus informations sur les directives d'interprétation.
Les tests sont effectués, en totalité ou en partie, au moyen d’une trousse d’analyse destinée à des fins de recherche seulement et qui n’a pas été entièrement validée ni vérifiée.
21 jours civils pour les échantillons reçus au LNM. 5 jours civils pour l’analyse des données de SGE reçues au LNM. À noter : Les délais d’exécution pour les isolats de routine peuvent être prolongés durant une éclosion majeure de toxiinfections alimentaires ou en raison d’une disponibilité limitée de ressources.