Typage moléculaire de Neisseria gonorrhoeae par séquençage de plusieurs antigènes (NG-MAST) à partir d’échantillons positifs pour la gonorrhée soumis à un test d’amplification des acides nucléiques (TAAN).

Typage de Neisseria gonorrhoeae par séquençage de plusieurs antigènes (NG-MAST) à partir d’échantillons soumis à un test d’amplification des acides nucléiques (TAAN).

Echantillons positifs pour la gonorrhée conservés dans un tampon APTIMA ou Roche Cobas, notamment l’urine, les prélèvements urétraux/urogénitaux, les prélèvements vaginaux et les prélèvements rectaux, ou des extraits d’ADN. L’urine non diluée et les prélèvements pharyngés ne sont pas recommandés.
D'autres types d'échantillons peuvent être acceptés s'ils sont justifiés par une raison valable ou sur autorisation préalable de la section des maladies bactériennes invasives. Le volume minimum requis est de 1 ml. Ne soumettez qu'un seul test GC TAAN par cas, sauf dans le cadre d'une enquête sur un échec thérapeutique.

Les échantillons peuvent être refusés s'ils ne correspondent pas au type d'échantillon approprié, si leur volume est insuffisant, s'ils ont fui pendant le transport ou s'ils ne sont pas accompagnés des informations pertinentes sur le patient.

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S/O

Réfrigérer ou congeler les échantillons jusqu’au moment de leur envoi pour analyse. Expédier les échantillons congelés sur de la glace sèche et les échantillons réfrigérés sur des blocs réfrigérants.

L’expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d’information sur la catégorisation des matières à des fins d’expédition, veuillez consulter la partie 2 de l’appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l’IATA sur les produits dangereux.

Infection par N. gonorrhoeae.

Formulaire de demande LNM GC TAAN rempli, avec le nom, l’adresse, le numéro de téléphone et l’adresse électronique du laboratoire expéditeur. Tous les renseignements sur les patients doivent être fournis, y compris l’identifiant (numéro de référence de l’échantillon), la date de naissance et le sexe du patient, la plate-forme d’analyse, la date de prélèvement, le site d’isolement et l’analyse demandée. S’il s’agit d’échantillons urgents, il faut le mentionner dans la demande et aviser le laboratoire avant qu’il ne les reçoive.

S/O

Les échantillons positifs à la gonorrhée, prélevés par NAAT et reçus au LNM en vue d’un test PCR, font d’abord l’objet d’une extraction à l’aide d’un kit disponible dans le commerce. Les résultats reposent sur des tests PCR qui amplifient les séquences de deux gènes, porB et tbpB, utilisés pour la détermination des types de séquence NG-MAST. Les types de séquence sont analysés et la combinaison des allèles porB et tbpB permet de déterminer le type NG-MAST de l’échantillon (1, 2). Ces résultats sont destinés exclusivement à des fins de surveillance.

S/O

1. Martin IMC, Ison CA, Foreman E, Hall V, Nesbitt A, Forster G, and Ison AC. Non-cultural detection and molecular genotyping of Neisseria gonorrhoeae from a piece of clothing. J Med Micro 2007;56:487-490
2. Martin IMC, Ison CA, Aanensen DM, Fenton KA, Spratt BG. Rapid sequence-based identification of gonococcal transmission clusters in a large metropolitan area. J Infect Dis 2004;189:1497-1505.
3. Peterson SW, Martin I, Demczuk W, Barairo N, Naidu P, Lefebvre B, Allen V, Hoang L, Hatchette TF, Alexander D, Tomas K, Trubnikov M, Wong T, Mulvey MR. Multiplex real-time PCR assays for the prediction of cephalosporin, ciprofloxacin and azithromycin antimicrobial susceptibility of positive Neisseria gonorrhoeae nucleic acid amplification test samples. J Antimicro Chemo. 2020; 75: 3485-3490.