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Détection des espèces Bartonella par PCR et séquençage

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Détails de la référence

Description:

Détection des espèces de Bartonella par PCR et séquençage.

Catégorie d'analyse:
Détection moléculaire et Génotypage
Agent pathogène:
Bartonella spp.
Infections et maladies:
  • Bartonellose
Spécimen:

Aspiration de liquide/pus ou écouvillonnage de la plaie, liquide et/ou tissu des ganglions lymphatiques, biopsie des valves cardiaques, biopsie du foie, biopsie de la rate, lésion cutanée, liquide oculaire, sang total ou liquide synovial.

Le volume minimum requis est de 5 ml de sang total ou de 0,5 ml pour les autres échantillons de liquide/liquide.

Les échantillons de LCR sont acceptables pour les analyses, mais ils ne sont pas idéaux en raison de leur rendement typiquement faible.

Méthode de prélèvement:

Recueillir le sang dans des tubes EDTA ou citrate de sodium. ÉVITER L'HÉPARINE.

Recueillir l'écouvillon ou le liquide aspiré de la zone suspectée d'infection. Les écouvillons doivent être fournis dans au moins 1 ml de milieu de stockage approprié et NON expédiés secs.

Des échantillons de biopsie tissulaire doivent être prélevés sur des ganglions lymphatiques ou des échantillons de valves cardiaques provenant de cas d'endocardite à culture négative.

Tissu frais ou inclus en paraffine (lésion cutanée) :

  1. Laver le site de biopsie avec du savon antiseptique. Rincer abondamment la zone avec de l'eau stérile. Ne pas utiliser de préparations à base d'alcool ou d'iode. Un anesthésique local peut être utilisé.
  2. Les échantillons de tissus frais doivent être envoyés dans une gaze humidifiée de solution saline et transférés dans un récipient stérile contenant 2 ml de solution saline.

Tous les échantillons doivent être fournis dans des tubes à bouchon à vis en plastique antigel-dégel et incassable.

Manipulation, entreposage et expédition des spécimens:

Aucun autre traitement n’est nécessaire après que les échantillons ont été prélevés conformément aux instructions ci-dessus. Si possible, congeler tous les échantillons immédiatement après le prélèvement. Autrement, réfrigérer les échantillons pendant jusqu’à 5 jours. Expédier les échantillons congelés avec de la glace sèche et les échantillons réfrigérés avec des blocs réfrigérants.

Transport des marchandises dangereuses:

L'expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d'information sur la catégorisation des matières à des fins d'expédition, veuillez consulter la partie 2 de l'appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l'IATA sur les produits dangereux.

Pour obtenir des renseignements supplémentaires dans d’autres langues sur le transport de matières infectieuses, cliquez sur le lien ci-dessous.

http://www.who.int/ihr/capacity-strengthening/infectious-substances/fr/

Critères relatifs aux patients:

Les manifestations cliniques de l’infection à B. henselae (« maladie des griffes du chat ») peuvent comprendre des infections locales comme une lymphadénopathie subaiguë régionale, des lésions cutanées, des lésions musculosquelettiques, une endocardite à culture négative, une uvéite et une rétinite; cependant, certaines manifestations générales sont aussi courantes : fièvre, méningite, ostéomyélite et arthrite.

L’infection à B. quintana (« fièvre des tranchées ») est caractérisée par de la fièvre, pouvant être présente de façon unique ou récurrente, des maux de tête, des éruptions cutanées et des douleurs osseuses, principalement dans les tibias, dans le cou et dans le dos.

B. henselae et B. quintana peuvent tous deux causer l’angiomatose bacillaire chez les personnes immunodéprimées, comme celles atteintes d’une infection à VIH de stade avancé.

Documents d'accompagnement:

Requête pour l’analyse moléculaire de certains agents de zoonoses dûment complétée, comprenant les renseignements sur le patient et l’information clinique pertinente.  Si possible, fournir les antécédents cliniques et les résultats d’analyses effectuées par le laboratoire provincial ou local.

 

Commentaires:

Comme une infection à Bartonella peut donner lieu à des manifestations locales et générales, il est difficile de détecter avec précision l’agent infectieux à moins que les échantillons appropriés aient été envoyés aux fins d’analyse. Il est important de fournir uniquement les types d’échantillons figurant dans la liste. Les échantillons peuvent être rejetés s’ils ne sont pas du type approprié, si leur volume est insuffisant ou s’ils ne sont pas accompagnés des renseignements ou des antécédents cliniques pertinents sur le patient.

Méthodes et interprétation des résultats:

L’ADN extrait fait l’objet d’une analyse par PCR en temps réel capable de détecter toutes les espèces de  Bartonella. Les échantillons positifs au test de détection sont ensuite soumis à des analyses par PCR supplémentaires en temps réel visant spécifiquement B. henselae et B. quintana. Si nécessaire, une analyse par PCR classique et un séquençage sont réalisés pour identifier l’espèce.

La mise en route d’une antibiothérapie avant l’analyse peut réduire l’expression du génome bactérien et ainsi affecter les résultats de l’analyse par PCR.

Délai d'exécution:

21 jours civils. 

 

Coordonnées:
Téléphone: (204) 789-7434 or (204) 789-7662
Télécopieur: (204) 789-2082
Références:
  1. Raoult D, Roblot F, Rolain JM, Besnier JM, et al. 2006. First isolation of Bartonella alsatica from a valve of a patient with endocarditis. J Clin Microbiol. 44:278–9.
  2. Angelakis, E., Rolain, J. M., Raoult, D., & Brouqui, P. 2011. Bartonella quintana in head louse nits. Pathogens and Disease, 62(2), 244-246.
  3. Chomel B, Boulouis HJ, Maruyama S, Breitschwerdt EB. 2006. Bartonella spp. in pets and effect on human health. Emerg. Infect. Dis. (12):389-394.
  4. Raoult D. 2007. From cat scratch disease to Bartonella henselae infection. Clin. Infect. Dis. (45):1541-1542.
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