Détection des espèces Leptospira par PCR et séquençage

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Détails de la référence

Description:

Détection de Leptospira spp. par PCR et séquençage.

Catégorie d'analyse:
Détection moléculaire et Génotypage
Agent pathogène:
Leptospira spp.
Infections et maladies:
  • Leptospirose
Spécimen:

Sang total/tube EDTA – volume minimal requis : 2-5 mL; urine (aussi fraîche que possible pour prévenir la dégradation de Leptospira) – volume minimal requis : 5-10 mL; LCR – volume minimal requis : 400 uL.

 

Méthode de prélèvement:

Prélever de manière aseptique dans un contenant stérile approprié.

Manipulation, entreposage et expédition des spécimens:

Réfrigérer (2-8 °C) – ne pas laisser congeler le sang, l’urine ou le LCR. Expédier avec des blocs réfrigérants dans un contenant à l’épreuve des fuites. Le transport de nuit est recommandé.

 

Transport des marchandises dangereuses:

L'expédition des prélèvements doit être confiée à une personne détenant un certificat de formation TMD, conformément au Règlement sur le TMD. Pour plus d'information sur la catégorisation des matières à des fins d'expédition, veuillez consulter la partie 2 de l'appendice 3 du règlement ou la section 3.6.2 du règlement de l'IATA sur les produits dangereux.

Pour obtenir des renseignements supplémentaires dans d’autres langues sur le transport de matières infectieuses, cliquez sur le lien ci-dessous.

http://www.who.int/ihr/capacity-strengthening/infectious-substances/fr/

 

Critères relatifs aux patients:

Les symptômes d’une infection à Leptospira spp. peuvent comprendre les suivants : fièvre, céphalées, frissons, malaise général, éruption cutanée, vomissements, diarrhée, myalgies, suffusion conjonctivale, ictère, insuffisance rénale et/ou défaillance hépatique, méningite et douleurs thoraciques. Contact avec un animal infecté (chiens, bétail, ratons laveurs, rongeurs, etc.) ou voyage récent dans une région ou l’infection à Leptospira spp. est endémique.

 

Documents d'accompagnement:

Requête pour l’analyse moléculaire de certains agents de zoonoses dûment complétée.

 

Commentaires:

Les échantillons qui ne constituent pas le bon type d’échantillon, dont le volume est insuffisant, ou qui ne sont pas accompagnés des renseignements pertinents sur le patient ou des antécédents cliniques de ce dernier peuvent être rejetés.

La mise en route d’un traitement antibiotique avant l’analyse peut entraîner une production réduite d’anticorps qui altérera le résultat de l’analyse sérologique.

CE TEST EST EFFECTUÉ UNIQUEMENT À DES FINS D’ENQUÊTE OU DE RECHERCHE.

Méthodes et interprétation des résultats:

L’ADN extrait fait l’objet d’une analyse par PCR en temps réel ciblant le gène lipL32 dans les espèces de Leptospira. Les échantillons positifs au test de détection sont ensuite soumis à une analyse par PCR classique et à un séquençage du gène codant la citrate synthase aux fins d’identification de l’espèce de Leptospira.

Délai d'exécution:

21 jours civils.

Coordonnées:
Téléphone: (204) 789-7434 or (204) 789-7662
Télécopieur: (204) 789-2082
Références:
  1. Levett, P.N. Leptospirosis (2001) Clin. Micro. Rev. (14): 296-326.
  2. Stoddard R. A., Gee J. E., Wilkins P. P., McCaustland K., et al.2009Detection of pathogenic Leptospira spp. through TaqMan polymerase chain reaction targeting the LipL32 gene. Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 64:247255.
Lignes directrices:
Renseignements connexes: